Dibebaskan dari tugasnya di Organisasi 501, Motoko Kusanagi sekarang harus belajar bagaimana menerima perintah dari Aramaki. Seseorang hacks Logicomas, dan Batou enlists membantunya yang merupakan mantan perwira intelijen militer Ishikawa dan mantan ahli Borma artileri udara. Kusanagi juga berusaha untuk meminta sniper elite bernama Saito dan polisi yang menyamar Paz ke Bagian Keamanan Publik baru 9. dua kelompok saingan satu sama lain dalam kasus yang melibatkan seorang pria yang menerima kenangan palsu dari operasi transportasi pengungsi.

Ceritanya bermula ketika Motoko terbangun dari mimpinya bersama Batou, yang mengintip mimpinya. Dia kemudian memberitahunya untuk tidak melihat lobi mentalnya saat dia sedang istirahat, yang akhirnya dia pun meminta maaf akan hal itu. Dia melaporkan bahwa ada sebuah pemboman oleh teroris, dan Matoko menugaskannya untuk membawa semua orang ke tempat kejadian. Di samping Makoto, kekasihnya yang bernama Akira Hose bangun dari tempat tidur, dan bertanya apakah dia ada pekerjaan. Dia menjawab dengan sebuah maaf, dan Akira memberitahu Makoto bahwa waktu terlama dia istirahat adalah lima jam dan tujuh menit, kemudian mengijinkannya pergi dengan sebuah ciuman.

Seri ke-empat ini mengambil setting ketika terjadi perang pada musim dingin tahun 2028. Ketegangan meningkat di New Port City karena pada demonstran sedang berdemo besar-besaran. Hal ini menyebabkan terjadinya aksi tembak-menembak antara polisi dan para demonstran. Lalu, apa yang akan terjadi dalam insiden tersebut ?

Pada tahun 2027, setahun setelah berakhirnya Perang Dunia IV non-nuklir, sebuah bom meledak di Newport City, menewaskan seorang pedagang senjata besar yang mungkin memiliki hubungan dengan Organisasi 501 yang misterius. Pejabat Keamanan Publik, Daisuke Aramaki, mempekerjakan pengguna prostesis cyber seluruh tubuh dan hacker luar biasa, Motoko Kusanagi, untuk menyelidiki.

Hideki Tahara (Satoshi Tsumabuki) dan Kana Tahara (Haru Kuroki) adalah pengantin baru. Hideki bersemangat tentang masa depannya dengan Kana. Suatu hari, seseorang yang misterius mengunjungi perusahaan tempat Hideki bekerja. Rekan Hideki menyampaikan pesan pengunjung kepada Hideki “tentang Chisa-san.” Begitu Hideki mendengar nama Chisa, dia menjadi tercengang. Istrinya hamil dan mereka memilih nama Chisa untuk bayi mereka. Hanya Hideki dan Kana yang tahu. Tak lama kemudian, kolega yang berbicara dengan pengunjung itu mengalami kematian misterius. 2 tahun kemudian, kasus yang lebih misterius terjadi di sekitar Hideki. Dia kemudian diperkenalkan kepada penulis lepas Nozaki (Junichi Okada) dan pacarnya Makoto Higa (Nana Komatsu).

Mahasiswi Nao Kanzaki selalu mematuhi arti namanya: "bodoh jujur." Namun setelah membuka paket yang tidak diminta yang berisi seratus juta yen, ia tanpa sengaja menerima undangan untuk "Liar Game." Dalam turnamen ini, kontestan didorong untuk mengkhianati dan menipu lawan mereka untuk mendapatkan uang tunai dalam jumlah besar; sebaliknya, kalah akan menimbulkan hutang seumur hidup. Dengan semua harapan hilang, satu-satunya pilihan yang tersisa adalah mencari bantuan dari penipu.Di hari yang sama, penipu terkenal Shinichi Akiyama akhirnya dibebaskan dari penjara. Mantan mahasiswa psikologi ini dikenal karena membangkrutkan seluruh perusahaan sendirian, dan Nao percaya ia adalah satu-satunya kesempatannya melarikan diri dari situasi mengerikan. Awalnya, Shinichi ragu untuk melakukan kejahatan lain, mengabaikan Nao dan permintaannya. Tapi setelah melihat keputusasaan dan ketekunannya, ia setuju membantu.Di dunia penipuan ini, Nao dan Shinichi punya motif mereka sendiri. Namun segera mereka melihat sifat sejati tidak hanya permainan, tetapi juga semua orang yang terlibat.

“Kegelapan tidak akan berakhir.” Di tengah hari-hari tenang yang hanya sebentar, Selector Battle menghantui lagi. Kiyoi Mizushima yang menyadari kejadian aneh, mulai bergerak untuk memutus rantai kegelapan. Kartu “kunci” ditambahkan pada Battle tersebut. Berbeda dari sebelumnya, peraturan yang sudah dirancang menyimpan banyak misteri mengenai pemimpin kelompok dan tujuan mereka, yang membuat kegelapan semakin kuat. Suzuko Homura, Chinatsu Morikawa, Hanna Mikage, Ruko Kominato, Yuzuki Kurebayashi, Hitoe Uemura, dan Akira Aoi … Para Selector berkumpul kembali untuk melakukan Final Battle dengan mempertaruhkan “Keinginan”, “Ingatan”, dan “Kunci” mereka.

Cerita berlatar sesaat setelah pertarungan Wixoss usai. Kehidupan Suzuko pun berjalan dengan damai. Namun, suatu ketika, Piruluk menghampiri Suzuko dan mengatakan bahwa kegelapan masih belum berakhir, dan pertarungan masih akan terus berlanjut.

Sekumpulan gadis dikisahkan terpilih menjadi Selector untuk kemudian mengikuti permainan rahasia yang mempertaruhkan keinginan mereka masing-masing, dan seri kali ini bercerita tentang seorang gadis bernama Suzuko yang ingin mendapatkan kembali kenangan bersama teman masa kecilnya, Chinatsu.

Sebuah fenomena aneh yang disebut Mumyou Ryouiki mendadak muncul di tengah-tengah Kota Tokyo. Fenomena ini menyelubungi suatu wilayah dengan kegelapan pekat, dan mengubah semua yang terperangkap di dalamnya menjadi kristal-kristal metalik, yang darinya kemudian muncul makhluk-makhluk Imashime yang akan menyerang orang-orang. Sebagai institusi yang dipercaya untuk meneliti Mumyou Ryouiki, Ix menyimpulkan bahwa penyebabnya adalah makhluk yang bernama Mukuro, dan untuk bisa mengalahkannya, mereka membutuhkan sekelompok pemuda dan gadis yang pikiran mereka saling terhubung oleh suatu kemampuan serupa telepati. Saginuma Akashi, Namito Iwato, Yuuzuki Maamu, Hazaki Emiru, Kasumi Laica, Ikusa Heito, Izuriha Sasame, dan Maki Minashi pun dikumpulkan dan dilatih, namun ketika akhirnya berhadapan langsung dengan Mukuro, mereka segera tersadar bahwa keterlibatan mereka dengan Mumyou Ryouiki ternyata telah dimulai sejak lama sebelumnya.

Tokoh utama Magia Record adalah Iroha, seorang gadis penyihir yang sedang mencari adik perempuannya yang hilang, Ui di Kamihama. Sementar di Kamihama Madoka juga mencari Homura yang menghilang.

Musim kedua Anime Magia Record: Mahou Shoujo Madoka☆Magica Gaiden

Menceritakan kisah Asagiri Aya. Seorang Gadis sekolahan yang sering di bully oleh teman-temannya di sekolah, Bahkan kakaknya berada dirumah juga ikut membullynya. Suatu hari, Asagiri terkejut melihat layar komputernya tiba-tiba menyala sendiri dan langsung terhubung ke situs mengerikan bernama Situs Mahou Shouju. Apa yang akan terjadi selanjutnya?

Rune Ballot adalah pelacur remaja di Mardock City. Suatu hari seorang manajer kasino yang sangat ambisius Shell, membawa Ballot dan memberikan segala apa yang Ballot inginkan. Mulai dari kepribadian palsunya yang baru, masa lalu yang palsu, dan sekarang Shell juga memberikan kehidupannya yang palsu. Walaupun Ballot senang dengan kehidupan yang diberikan oleh Shell akan tetapi ia merasa ingin tahu apa yang sebenarnya terjadi di kehidupan Shell. Akan tetapi, keingintahuan Ballot tersebut malah menjadi malapetaka baginya. Shell mengetahui setiap gerak gerik Ballot dan akhirnya membunuh Ballot dengan meledakan mobil yang ditumpangi Ballot. Singkat cerita, pada saat itu ada sistem ilegal dari kepolisian yang dinamakan dengan ?Scramble 09? yang dimana sistem tersebut mengutus seorang profesor untuk memperbaiki sel-sel manusia yang rusak menjadi serat-serat sintesis dan kemudian menjadi sebuah Cyborg. Apa hubungannya Ballot dengan sistem Scramble 09?

Kelanjutan dari Mardock Scramble 1: The First Compression, Rune Balot menangis dan mencoba menyelamatkan dirinya dan Oeufcoque yang terluka parah dari pembunuh surhan Shell, Boiled. Untungnya, Dokter Easter muncul dari dalam Humpty Dumpty -kendaraan militer khusus yang dibuat untuk melindungi mereka dalam kasus Kesejahteraan jika nyawa mereka terancam. Dari sana mereka pergi ke Paradise, di mana tekhnologi Scramble 09 (dan tempat kelahiran Boiled ) dikembangkan. Semua rahasia masa lalu Mardock City (dan mungkin masa depan) yang terungkap dalam bagian kedua dari seri memukau Mardock Scramble, Menaikan taruhan dan membuat Balot memilih antara keadilan bagi dirinya atau perdamaian dalam surga (paradise) sebagai gantinya.