Pada suatu ketika, musuh tak dikenal, Unknown, tiba-tiba muncul. "Badan Pengembangan Kereta Api Super Evolusioner" telah mengembangkan "Shinkalion", sebuah robot yang dapat berubah menjadi kereta peluru, sebagai tindakan balasan terhadap ancaman ini.

Di side storynya, Hayato Hayasugi (nama belakangnya berarti “sangat cepat”), anak laki-laki dari kurator museum kereta yang sangat mencintai kereta api, secara tidak sengaja terjebak di laboratorium penelitian rahasia ayahnya. Di dalamnya ia menemukan kereta peluru E5. Begitu dia masuk, dia mendengar sebuah pengumuman bahwa seorang musuh misterius, Bachigami (“dewa lebah”), menyerang kota New Saitama. Untungnya, dengan sentuhan kartu Shinca (“evolusi”) ayahnya, kereta peluru dia berubah menjadi robot yang hebat – Shinkalion E5 Hayabusa. Dalam cerita anime, Hayato dan anak-anak lainnya akan menjadi konduktor untuk pilot Shinkalion. Anak-anak harus bekerja sama dengan orang-orang dewasa dari “Shinkansen Ultra Evolution Institute” (SUEI) untuk mengalahkan monster yang terlihat seperti kereta peluru hitam.

Shinji Ikari terpuruk secara emosional setelah kematian teman dekatnya. Dengan sang putra yang secara mental tidak mampu mengemudikan robot humanoid Evangelion Unit-01, NERV milik Gendou Ikari berlomba melawan organisasi bayangan SEELE untuk melihat siapa yang bisa melaksanakan rencana utama mereka lebih dulu. SEELE ingin menciptakan sosok seperti dewa dengan menyatukan jiwa mereka ke unit Evangelion, sementara Gendou ingin mengembalikan seluruh umat manusia menjadi satu makhluk primordial agar bisa bersatu kembali dengan Yui, istrinya yang telah meninggal.SEELE melepaskan kekuatan militernya dalam invasi mematikan ke markas NERV. Saat pasukan SEELE membantai ilmuwan dan personel keamanan NERV, Asuka Langley Souryuu mengemudikan Evangelion Unit-02 dalam pertahanan terakhir yang putus asa melawan persenjataan terberat SEELE. Pertempuran berkecamuk, dan Shinji yang depresi bersembunyi jauh di dalam markas NERV. Dengan nasib dunia berada di tangan Shinji, Kapten Misato Katsuragi memburu bocah remaja itu saat masyarakat runtuh di sekeliling mereka.

Ketika seseorang mati, mereka kehilangan 12gram berat badannya. Dari situ dr. John watson dan rekannya melakukan pengujian, alhasil mereka berhasil menciptakan roh palsu, sehingga orang yang telah mati dapat dihidupkan kembali. Namun, orang yang telah hidup kembali itu tidaklah seperti orang normal pada umumnya. Dipertualangannya bersama orang-orang yang baru dikenalnya, John Watson mencari sebuah catatan bernama Catatan Victor. Akankah John Watson dapat menemukan catatan itu? Dan Siapakah mayat hidup yang bersamanya dalam pertualangan? Sedot langsung, gan!

Sepasang ilmuwan telah ditangkap karena melakukan pecobaan ilegal, yaitu memodifikasi genetik pada lima anak-anak mereka. Anak termuda Dannis adalah satu-satunya yang tumbuh sebagai manusia normal dan sekarang harus merawat seluruh keluarganya dan mencoba menemukan obat untuk mengubah mereka menjadi manusia normal lagi. Manusia anjing, tumbuhan, laba-laba, dan pembaca pikiran – bagaimana anggota keluarga ini yang dibesarkan di laboratorium, bisa bertahan hidup di dunia luar ?!

Bercerita tentang petualangan 2 gadis bernama Chito dan Yuuri di dunia pasca apokalips. Ditemani dengan sepeda motor kettenkrad, mereka menjelajah kota dan reruntuhan, mencari bahan bakar dan makanan. Walau keadaan sulit dan suram di kala mereka menyeruput sup atau di saat mencari onderdil untuk memperbaiki mesin, di dunia yang kosong ini hanya pengalaman dan perasaan saling menjaga yang membuat mereka bertahan.

Pada tahun 2200, sebuah Perang Dingin baru antara dua kekuatan diatur untuk diakhiri dengan sebuah perjanjian damai. Namun, disatu sisi menyembunyikan rahasia gelap, yang menghasilkan banyak tragedi dalam bulan-bulan berikutnya. Setelah krisis, sebuah tim paramiliter didirikan untuk mencuri informasi di tengah konflik.

500 tahun telah berlalu sejak manusia mengalami kepunahan ditangan “Mahkluk Buas”. Bahkan di atas langit, dimana ras yang masih bertahan tinggal di pulau-pulau mengambang, makhluk-makhluk tersebut terus memberikan ancaman kematian dan kehancuran. Hanya sekumpulan gadis muda yang bernama Leprechauns dapat menggunakan senjata kuno yang dibutuhkan untuk mengalahkan makhluk tersebut. Di hidup para gadis muda yang tidak stabil dan rawan dari kematian, masuklah seorang karakter lelaki bujangan yang telah kehilangan segala yang dimilikinya pada 500 tahun lalu, manusia terakhir yang hidup dan terbangun dari tidur dingin yang panjang.

Sekarang tahun 2040. Reito, mengalami rasa sakit yang tak tertahankan. Untuk mengurangi rasa sakit itu ia tidur. Namun, lima tahun kemudian ── Reito terbangun dan mengetahui fakta mengejutkan bahwa 99,9% laki-laki di dunia meninggal dan 5 miliar perempuan masih hidup. Masa depan baru yang penuh gairah tepat berada di depannya.

Dua gadis mengayuh sepeda menyusuri reruntuhan Jepang yang sunyi setelah kiamat tiba. Meski peradaban telah runtuh, semangat mereka untuk menjelajah dan menikmati pemandangan tak pernah padam.Sendirian di dunia yang telah berakhir, perjalanan mereka tetap berlanjut.

Sudah ratusan tahun berlalu sejak Gauna, sebuah ras alien asing dengan metode komunikasi yang tidak diketahui, mengancurkan tata surya. Sekumpulan manusia melarikan diri menggunakan “kapal bibit” yang sangat besar seperti Sidonia. Yang bisa mempertahankan kehidupan mereka yang terseret-seret diluar angkasa. Nagate Tanikaze adalah seorang anak muda yang tumbuh jauh di dalam bawah kapal itu. Saat dia latihan untuk menjadi pilot robot bersenjata yang dikenal sebagai Gardes, Nagate dipercayakan untuk memiloti sebuah unit legendaris yang dikenal sebagai Tsugumori. Nagate dan teman-teman pilotnya mempertaruhkan nyawa mereka melawan Gauna, dalam pertempuran dahsyat demi mempertahakan umat manusia!

Nyaris menghindari tabrakan dengan asteroid, Sidonia menetapkan kursus untuk sistem Lem untuk menghancurkan sarang Gauna.

Yukio hancur dalam pertempuran dan Tetsuo selamat dalam escape pod. Setelah delapan tahun dalam cold sleep, escape pod akhirnya mendarat kembali di Bumi. Tapi ketika Tetsuo muncul, ia menemukan dunia dalam reruntuhan, sepenuhnya beku di bawah selimut es dan salju—snowball Earth!Apa yang terjadi pada umat manusia, bagaimana planet bisa membeku, dan akankah Tetsuo bisa memenuhi janji terakhirnya kepada Yukio?

Ruang kelas kosong, hari-hari yang membosankan. Seharusnya liburan musim panas yang normal seperti yang lain. Tiba-tiba, sekolah mulai melayang melalui dimensi lain, dan 36 anak laki-laki dan perempuan tertinggal di sana, terbangun dengan kemampuan supernatural mereka. Di tengah pusaran air pertanyaan yang datang ke pikiran satu demi satu, kelangsungan hidup di dunia supranatural dimulai.